Attorno al 150 a.C. i Romani costituirono a Marettimo un presidio militare che controllava la rotta tra Capo Bon e Roma. L’area archeologica oggi ospita il complesso monumentale noto come Case Romane.

L’insediamento presenta sia strutture romane (I a.C. - IV d.C.) dedicate al culto delle acque sia una chiesetta rurale di epoca normanna (XI-XII d.C.), costruita dai monaci Basiliani. I due edifici avevano destinazioni diverse: “case romane” ha carattere di tipo militare, giacchè  da lì si ha infatti un perfetto controllo del mare, ben visibili Levanzo, Favignana e la costa di Trapani; la chiesetta bizantina ha natura religiosa.